Annie est une orpheline. Un jour, pour aider son image de marque, le richissime M. Warbucks l’invite à passer une semaine dans sa luxueuse résidence. L’homme s’attache à la fillette et décide de l’adopter, mais la jeune fille refuse, car elle rêve du retour de ses parents. Le milliardaire offre donc une récompense pour leur retour, ce qui les amène à faire face à de nombreux fraudeurs.

Inspiré de la célébré bande dessinée « Little Orphan Annie », créée en 1924 par Harold Gray, « Annie » raconte l'histoire d'une orpheline de 10 ans qui doit se battre contre la méchanceté et le despotisme de ses geôliers. Sa rencontre avec le milliardaire Olivier Wabucks va renverser la situation.